SeaMonkey 1.0 ist im Januar 2006 erschienen, ein Jahr darauf folgte eine Version 1.1. Nochmals drei Jahre später beendet das SeaMonkey-Projekt die Wartung der 1.x-Serien zugunsten von SeaMonkey 2.0 - einer Version, die nicht nur moderner ist, sondern auch gewartet wird, um Stabilitäts- und Sicherheitsprobleme zu beseitigen.

Da die SeaMonkey-1.x-Serie wegen knapper Ressourcen keine Sicherheits-Updates mehr erhält, raten die SeaMonkey-Entwickler Benutzern dieser Versionen dringlich, die neue Version zu installieren. Zusätzlich rät das Team weiterhin auch auch Personen, die noch das alte "Mozilla"-Gesamtpaket bzw. Netscape 4, 6 oder 7 verwenden, auf die neue Version SeaMonkey 2.0 umzusteigen. All jene älteren Produkte leiden an einer bereits großen und weiter steigenden Anzahl an bekannten Sicherheitsmängeln, weil sie nicht weiter gewartet werden.

Alle Benutzer auf halbwegs modernen Betriebssystemen wird dringend empfohlen, auf die neuesten Versionen umzusteigen, die zum kostenlosen Download von den Webseiten des Open-Source-Projekts auf www.seamonkey.at oder www.seamonkey-project.org verfügbar sind und die bekannte, gleiche Basisfunktionalitätdes Gesamtpakets in eine modernisierten Anwendung mit zusätzlichen Funktionen und laufend aktuellen Sicherheits-Updates bieten.
Für die wenigen, die das nicht machen können, ist eine letzte 1.x-Version verfügbar. SeaMonkey 1.1.19 löst einige Sicherheitsprobleme, aber nicht alle bekannten Sicherheitslücken, von denen manche sogar schlimm sein könnten. Diese sind nur im neuen SeaMonkey 2.0 gelöst, und nur diese Version wird weiterhin für jegliche Sicherheitsprobleme, die auftauchen könnten, aktualisiert, während das Team daran arbeitet, das bekannte Gesamtpaket in zukünftigen Versionen weiter zu entwickeln.